Отделение функциональной диагностики было организовано с 01.01.2002 года и занимает 7 кабинетов, полностью оснащенных аппаратурой для нейрофизиологических исследований, для диагностики заболеваний сердечно-сосудистой системы, ультразвуковой диагностики органов и систем.
В отделении работают 6 врачей, 5 медсестер с опытом работы более 10 лет. С 2011 года заведует отделением врач высшей категории Молчанова НИ. Врачи в совершенстве владеют всеми методиками, представленными в отделении, что позволяет быстро и качественно оказывать диагностическую помощь специалистам клинических подразделений.
Современная аппаратура представлена компьютерными электроэнцефалографами, реографами и эхоэнцефалографом, стационарным и портативным ЭКГ-аппаратами, аппаратами для ультразвуковой диагностики.
Функциональные методы диагностики широко применяются с целью выявления патологии, дифференциальной диагностики заболеваний, контроля эффективности проводимого лечения.